AFPDzekos mål kom i den 22:a minuten. Trollgubben David Silva stod för inlägget som den bosniske anfallaren skarvade in bakom Wigan-keepern Ali Al Habsi.
Fullträffen var Dzekos elfte i ligan den här säsongen, men den första på över två månader. Den senaste gången 25-åringen lyckades näta var mot QPR, den 5 november förra året.
City gjorde inte en av sina bättre insatser. Wigan tryckte på framåt och jagade ett kvitteringsmål under hela den andra halvleken. Men målvakten Joe Hart stod för ett par högklassiga räddningar och höll Wigan stången.
Manchester City roffar åt sig en trepoängsledning före stadsrivalen United i ligatoppen. Wigan ligger sist, men har bara två poäng upp till Blackburn på rätt sida strecket.
Jens Dahlkvist - eurosport.se
